อาการของผู้ป่วยที่มีถุงน้ำในไต ในระยะแรก พบว่า ผู้ป่วยจะ ปวดหลังบริเวณเอว มีไข้ ปวดท้อง ปัสสาวะมีเลือดปน มีนิ่วในไต อาการของโรคถุงน้ำในไต จะแสดงออกกับอวัยวะอื่นๆ เช่น เกิดเส้นเลือดในสมองโป่งพอง โดยอาการของผู้ป่วยจะพบว่าปวดหัวอย่างรุนแรง เวียนหัว คลื่นไส้อาเจียน เกิดเลือดที่สมองและอาจทำให้เสียชีวิตได้ นอกจากเส้นเลือดในสมองโปงพองแล้ว เกิดอาการผนังหน้าท้องอ่อนแอ ทำให้เกิดไส้เลื่อน